【R语言】clusterProfiler富集分析，物种注释数据库
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飞起
2024-11-29 16:25:02
对于初次接触的用户，我们还提供了视频教程，从基础概念到具体操作，全方位指导。例如，对于GO富集分析，有专门的课程来帮助理解并解读分析结果。KEGG富集分析也同样支持，包括通路图的展示。
然而，富集分析的关键在于选用合适的物种注释数据库。对于人类基因，我们通常使用org.Hs.eg.db。当涉及到其他物种，如小鼠、大鼠或线虫等，我们需要从bioconductor.org/packages/...这个网站获取相应的物种注释文件。只需将代码中的org.Hs.eg.db替换为所需的数据库即可，比如换成小鼠的注释。
以上内容都已整理为一系列的教程和参考资料，覆盖了从基础操作到高级分析的全过程。无论你是新手还是进阶用户，都能在这些资源中找到所需的信息，进行物种特定的富集分析。
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