python实现批量nii文件转换为png图像

不是所有的故事都能成为你的眼睛里的色彩,因为岁月会淡化你的颜色。当你的人生路走得不平顺的时候,不要忘记了,你只是走过这条路而已,走过以后一切只能任时光处置。

之前介绍过单个nii文件转换成png图像:

https://www.haodaima.com/article/165693.htm

这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。

import numpy as np
import os    #遍历文件夹
import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包
import imageio   #转换成图像
 
def nii_to_image(niifile):
 filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹
 slice_trans = []
 
 for f in filenames:
  #开始读取nii文件
  img_path = os.path.join(filepath, f)
  img = nib.load(img_path)    #读取nii
  img_fdata = img.get_fdata()
  fname = f.replace('.nii','')   #去掉nii的后缀名
  img_f_path = os.path.join(imgfile, fname)
  #创建nii对应的图像的文件夹
  if not os.path.exists(img_f_path):
   os.mkdir(img_f_path)    #新建文件夹
 
  #开始转换为图像
  (x,y,z) = img.shape
  for i in range(z):      #z是图像的序列
   silce = img_fdata[i, :, :]   #选择哪个方向的切片都可以
   imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce)
            #保存图像
 
if __name__ == '__main__':
 filepath = 'nii的文件夹'
 imgfile = 'image的文件夹'
 nii_to_image(filepath)

代码是我自己写的,用于处理ADNI的nii格式完全有效。

到此这篇关于python实现批量nii文件转换为png图像就介绍到这了。你我都是宇宙间一粒微尘,细小却圣洁,俯仰无愧于天地,取舍叩问过良心,可以安心地睡,快乐地醒,无憾地死,这何尝不是最美的人生!更多相关python实现批量nii文件转换为png图像内容请查看相关栏目,小编编辑不易,再次感谢大家的支持!

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