Pthon批量处理将pdb文件生成dssp文件

与此形成鲜明对比的是另一位巨星——葡萄牙队的c罗。上赛季他虽说有42个进球,但经统计,他的效率不到10%。在这个习惯统计学的社会,c罗的42球从深层分析充满了水分。此外,他的球场道德也属于低劣派,假摔贯穿全场,无处不在,江湖人送外号 "跳水运动员 ",桃色风波更是五花八门,而两者后果呢?看看吧:梅西凭借着08—09赛季带领巴萨取得西甲、国王杯、欧洲冠军联赛三冠王,取得433分,获得金球奖,而c罗只有他的一半不到!
# -*- coding: utf-8 -*-
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Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015

@author: chaofn
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import os

"""
这个程序的目的是将linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目录中的所有文件(一共有215个文件)
批处理
将pdb文件生成dssp文件

"""
#listdir返回文件名的列表
fileLine=os.listdir('/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb')
#遍历整个列表
for i in range(len(fileLine)-1):
  #将字符串用变量表示
  input_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/'+fileLine[i]
  #先去掉文件名的后缀,然后形成后缀为dssp的文件名
  out_file=fileLine[i].split('.')[0]+'.dssp'
  output_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/'+out_file
  #注意:参数的传递(先是%s,然后是%变量名),多个变量的传入要用元组表示,在元组前用%
  os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))

本文Pthon批量处理将pdb文件生成dssp文件到此结束。命运,是一个很飘渺的东西,有人相信命运,走到了塔顶,或者坠落到崖底。有人想逆天改命,但成功的几率,与中彩一样,但有了毅力,终有那么一天,前方,不再是灰色的雾。小编再次感谢大家对我们的支持!

标签: Pthon pdb